A l'ouest de la forêt de Blois, la vallée de la Cisse Blésoise correspond au cours moyen de la rivière. Elle s'étend de Saint-Bohaire à Chouzy-sur-Cisse, décrivant de nombreux méandres sur une quinzaine de kilomètres avant de déboucher sur la vallée de la Loire. Elle est large de 500 mètres en moyenne.